Bionano Genomics, Inc. beschleunigt Datenverarbeitungslösung für Optical Genome Mapping Workflow mit NVIDIA
Am 12. Januar 2023 um 14:00 Uhr
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Bionano Genomics Inc. kündigte eine Zusammenarbeit mit NVIDIA an, um eine Beschleunigungsplattform für den Einsatz in Bionanos Optical Genome Mapping (OGM) Workflow zu entwickeln. Es wird erwartet, dass diese Zusammenarbeit die Geschwindigkeit der Datenverarbeitung erheblich verbessert und gleichzeitig den Zeit- und Kostenaufwand für die Sekundäranalyse von OGM-Daten reduziert. Die Rechenplattform ist so konzipiert, dass sie nur wenig Platz im Labor und in der Informationstechnologie beansprucht, was einen schnellen dezentralen Einsatz ermöglichen würde.
Durch die Kombination des Fachwissens von NVIDIA im Bereich des beschleunigten Rechnens und der Fähigkeiten der professionellen NVIDIA RTXo 6000 Ada Generation GPU mit dem Wissen von Bionano über die Extraktion, enzymatische Behandlung und Analyse von DNA-Molekülen mit ultrahohem Molekulargewicht (UHMW) zielt die Zusammenarbeit darauf ab, vor Ort und in der Cloud Lösungen zu entwickeln, die mit dem erwarteten Datenerzeugungsbedarf von OGM-Workflows mit hohem Durchsatz Schritt halten. Die gemeinsame Lösung soll die Analyse von 96 Krebs-Workflows oder etwas mehr als 300 konstitutionellen Ganzgenomen pro Woche unterstützen und in die NxClinicalo-Software von Bionano für die Varianteninterpretation und Berichterstattung integriert werden. Bionano wird die Lösung zusammen mit NVIDIA auf dem Advances in Genome Biology and Technology (AGBT) General Meeting vorstellen, das vom 6. bis 9. Februar 2023 in Hollywood, Florida, stattfinden wird.
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