Der ehemalige Vizepräsident Saulos Chilima und neun weitere Personen wurden getötet, als das Militärflugzeug, mit dem sie unterwegs waren, am 10. Juni in einem Wald abstürzte.
Es wurde erwartet, dass Chilima Chakwera bei den Präsidentschaftswahlen im nächsten Jahr herausfordern würde.
Usi wird am Freitag im Amt vereidigt werden, so eine Erklärung der Regierung.
Er war zuvor Minister für natürliche Ressourcen und Klimawandel und ein enger Verbündeter von Chilima, der als sein Vizepräsident fungierte.